"パッシブモード" では Coda が動作しているコンピュータから FTP サーバへ向かってネットワーク接続します。逆に、非パッシブモードでは、FTP サーバから Coda が動作しているコンピュータにネットワーク接続されます。
Coda が動作しているコンピュータがファイアウォールや NAT ルータ（AirMac ベースステーションによって構成されたネットワークなど）の内部から FTP サーバにアクセスする場合、パッシブモードで接続する必要があるでしょう。
パッシブモードはデフォルトでオンになっています。特に接続に問題が無い場合、この設定を変更する必要はありません。
もし 両方 のコンピュータがファイアウォール（もしくは NAT ルータ）内にある場合、ファイルリストの取得や転送が行えないかも知れません。パッシブモードの設定をオン／オフしても状況が改善されない場合、サーバ管理者にご相談ください。
パッシブモードは FTP 接続でのみ設定が可能です。SFTP や WebDAV 等の他のプロトコルではこのような設定は必要ありません。